另一边，真嗣和葛城在赤木博士的带领下登上一艘准备好的快艇。
虽然很好奇为何建筑内部会有一片深不可测的湖泊，但真嗣却提不起兴趣询问，只是沉默地被动接受别人要求做的事情。
突然，一阵刺耳的警报后，机械播音员的声音从广播中传出：“全员进入第一种战斗配置！”
“重复一次，全员进入第一种战斗配置。”
“地对地迎击，准备启动初号机！”
真嗣靠在快艇边缘，一边为所谓地听着广播，一边看着美里小姐的脸色陡然变得震惊起来，似乎初号机这个不知所谓的词语给她带来的极大的困扰。
已经坐好的葛城站起身，仰着头对着广播发出的方位大声问道：“等等，这是怎么回事？”
但没有任何回应，反而是坐在前面驾驶快艇的赤木博士接了话：“初号机处于B型战备状态，目前正冷却中，因为之前失败了一次，但现在随时可以再启动。”
葛城扭头反驳道：“我不是指这个啦！之前的通知中不是说零暂时受伤，不能出击的吗？驾驶员要从哪里来？”
赤木博士没有接话，只是侧下头意味深长地瞥了眼身后，欲言又止，但身后两人都没有注意到。
一直没等到赤木回应的葛城只得泄气般坐了下来，低声抱怨道：“司令他···到底在想什么呀···”
真嗣很是茫然，因为他发现自己完全听不懂两人的对话，但他竖起耳朵，想要搞清楚爸爸究竟在干什么，为什么连自己的儿子都不来看上一眼。
快艇划开平静的湖面，身后留下道道涟漪，前侧打开的探照灯照亮了湖面，借着微弱的灯光，真嗣能面前看清湖边有巨大的管状物，互相纠缠着深深探入水中，不知往何处去。
真嗣只是瞥了眼就收回目光，他仔细聆听着前方两人的对话，连岸上那只突兀地探出墙壁的巨人的手都忽视掉了，可惜风声太大，只能听到风中带来的只言片语。
“这么说，NN地雷完全对···起不到一点作用吗？”
“嗯···只对表···造成损害，他依旧在前进。”赤木博士沉默片刻，似乎在思量到底能不能当着外人的面说出秘密。
真嗣趁机往前凑了凑，想听得更清晰点。
赤木博士有注意到他的动作，但她还是接着说道：“现在的数据分析出第三使徒同样也拥有绝对领域，而且···还具有学习能力，不过那位——光之巨人——哦，这是最开始一位副指挥官取的名字，现在就这样叫了下来，巨人最开始的拳击似乎对使徒造成了一定伤害，因为我们检测到使徒被击中的地方依旧有能值残留。但使徒似乎很快便注意到巨人的格斗水平并不高，它利用高级格斗技巧、高速移动以及强力光束进行连续攻击，将巨人击败，对此巨人全无还手之力。我方猜测巨人受创较深，消失是因为维持巨大身体的能量耗尽，但巨人是谁？巨人在哪？我方仍是不知。”
“此外，经此一战后，根据电脑分析数据发现，使徒并不是外部遥控或者依照具体程式运作的。”
“简单的说，它，应该是他是一种巨型智慧生命体，有自己的意识！”
葛城被一连串的消息震惊到了，真嗣也不知从何挑起话题，因为他此时仍旧是懵逼状态，信息太多一下子处理不过来了。
因此接下来一路无话。
在快艇灯光探照不到的黑暗中，一只巨大的机械手臂从湖岸的墙壁内探入黑漆漆的水中，相较来说，几米长的快艇都显得渺小许多。
远远地，能看到前方通道大门上悬挂的指示灯，如灯塔般指引着快艇前进。
“到了，就是这里。”赤木博士提前宣布道。
快艇很快到达此行终点，他们从一处楼梯通道进入湖岸的墙壁中。
通道里非常黑暗，借着通道大门微弱的灯光，葛城拉着真嗣摸索着前进，还不时提醒道：“小心点，这里很黑的。”
在真嗣的印象中，三人又往前走了许久，直到赤木博士突然快走几步，“咔嚓”一声摁下灯光开光。
嘭嘭嘭。
灯光依次亮起，一个足有两三层楼房高的巨大头颅出现在视野中，幽深的湖水掩盖了大部分身躯，让人不由幻想深藏水下的身体该是有多么庞大。
仿人颅的外骨骼装甲竖在几人面前，高挺的颧骨，裸露的牙槽装饰，每一处都散发着冰冷的金属感。
那头部正中央还有一支苍角刺向天空，多边形的双眼正空泛地瞪着桥上几人，给他们，尤其是真嗣带来了绝大的冲击感。
这是一种与之前趴在自己头顶的巨人带来的温暖与安心绝然不同的感受，这里有的仅是种狰狞感与冰冷感，以及与人类极为相似的不适感，那种巨物当面的压抑感比得知眼前这竟是机械生命体来得更加震撼，似乎若是苏醒过来，掀起的将会是一场腥风血雨。
真嗣不由发出惊呼声，随后便是灵魂质问：“这是···什么啊！机器人？”
美里小姐似乎经常来这儿，并没有表现得很惊讶，只是兀自感叹道：“不管看多少次，都不得不令人惊叹。”
赤木博士神情自若地解释道：“虽然外表看上去像是机器人，但严格意义上来说并不是的，而是人类制造的终极泛用决战武器，是人类最后的杀手锏，其名为——人造人EVANGELION，我们简称为EVA。而这架就是EVA的初号机。之前你们遇险本应由它前来支援，但它的驾驶员出了点意外。幸好有巨人救场，不论他是哪一方的，我们在这里都必须感谢他坚持到最后，让你们从容逃脱。”
真嗣喃喃道：“莫非···这也是···爸爸的工作吗？”
“没错！”一道低沉的声音响起。
EVA巨大头颅背后的墙壁上突然打开一道舱门，门内透着光线，逆着光，能看到一道不算瘦弱的身影站立其上，右手插在裤袋中，那种悠闲放松的姿态，仿若凌驾于EVA之上。