赣州城外明军和乡勇端着武器杀入城，城内清军还有四千多人，在八旗兵指挥下全部龟缩在城内，想和明军打巷战，可是秦楚不给他们机会，命令周福东等本土人士去喊话，只要投降，以前投降鞑子事情既往不咎，可以选择回家，也可以选择加入官军，要是继续负隅顽抗，不仅要被杀死，还会连累家人和父老乡亲。
城内绿营兵大部分都是赣州府本地人，有部分还是投降清军的乡勇，和明军那边乡勇都是熟人，在周福东喊话后，有一千多绿营兵选择投降，还有将近两千绿营兵仍然在顽抗，他们全部集结在赣州府校场，利用这里防御设施，和明军决一死战。
对于清军中的死硬分子，秦楚从来不手软，下令全军杀入校场，校场清军被杀散后，全部躲入到巷子中，明军以街道为目标，逐条街道进行清扫，只要是负隅顽抗者，统统消灭，到这个份上，残存八旗兵和绿营兵也不再心存幻想，和明军进行惨烈巷战，秦楚看着巷战爆发，有点后悔没有带一部分城防军过来，城防军可是巷战好手，遇到清军躲在屋子里，直接就是一坛子炸药扔进去，有点后世特种兵城市作战味道，不过赣州城绿营兵战斗力也不强，经过半天时间清扫，终于消灭城中清军抵抗势力，
将城中清军肃清后，秦楚正式开始全面接管赣州城，城中乡勇还有四千余人，被分成三部分，其中以岳令柒为首一千乡勇直接划给李长刀和郭渊部，两人各自分到五百人，其中岳令柒为郭渊部副千总，剩下两千多乡勇要求回归各地地主乡绅序列，对这些要求回归乡勇，秦楚也没有拒绝，大方让他们回去，剩下一千左右乡勇都是主力被打散的部队，全部被划分到曹宇宙部，用来充实曹宇宙部实力。
至于被俘虏两千多绿营兵，全部被剪掉辫子，这些人怎么处置，秦楚一时间也没有好办法，毕竟他们加入清军在先，想把他们吸纳到队伍中，恐怕使得军队战斗力和抗清意志大幅度下降。
周福东却和秦楚提出一个好法子，这些人都是俘虏，反正也没啥战斗力，还不如都分给各个地主做家奴，可以得到一大笔银子等补偿，还可以和本土人搞好关系，这个方法确实很不错，要不是杨巴龙一席话，秦楚差点就答应下来。
“大人，这些绿营兵是可恨些，但这么分掉着实可惜，下官认为何意让他们去屯田，帮助官府屯田，总比私人屯田更强。”
也正是因为杨巴龙这句话，让秦楚茅塞顿开，他把大量土地分给老百姓和有军功将士，真正掌握在指挥部手中土地却很少，这些土地也都被荒废，如果有这些俘虏帮忙开垦屯田，这会使得指挥部权利和威慑力大为增加，不仅可以压制本土势力，还能够加强对占领区域控制能力。
秦楚坠杨巴龙更加信任，也虚心接受杨巴龙建议，周福东又吃了一个憋，也无话可说，谁让秦楚才是真正朝廷命官呢？
做完这些后，秦楚命令赣州城戒严，同时命令徐仁才继续打探刘良能和杨遇明具体位置，徐仁才率领部下出城而去，有赣州府百姓帮忙，很快就打探到刘良能动向。
刘良能在安远县停留半天，又是虚晃一枪，把杨遇明引来后，调转方向由此一次北上，在新田和情报部官员接上头，终于知道赣州城已经被秦大人攻占，任务已经完成，刘良能也就没有必要再带着杨遇明兜圈子，直接率军撤回赣州城，在身后的杨遇明穷追不舍。
当他知道刘良能竟然往赣州城逃窜，心里那个得意，心想这群明军也是脑子发糊，竟然往赣州城逃窜，这不是送死的吗？
在距离赣州城还有半天路程，命令部将去赣州城调动绿营兵，和八旗兵一起夹击刘良能这伙明贼，结果派去赣州城的部将，刚刚进城就被岳令柒一刀砍死，他等了半天都不见部下回来复命，心里有些奇怪，反正刘良能骑兵就在赣州城附近，他的部队也需要短暂歇息，于是带着八旗兵直接回城。
此时在赣州城内，一片凌肃之景，在小南门门口，已经完全复原，看不出来这里不久前发生战斗痕迹，秦楚率领全军将士在城内设下伏击。
其中曹宇宙令一千将士在东门埋伏，郭渊领兵一千在西门埋伏，其余将士全部埋伏在小南门，这里是杨遇明回城必经之路，其他两们门比较狭窄，从小南门入城，可以直接进入校场，明军在小南门城门口六百米距离，二十门虎蹲炮已就位，只等清军入城，大炮齐发，利用虎蹲炮杀伤力及辐射范围面积大特点，最大限度杀伤八旗兵，其余士兵全部埋伏在小南门两侧，等待敌军完全进入小南门，全局伏兵尽出，将杨遇明等八旗兵关门打狗，全部歼灭。
杨遇明在回城途中一直等待部将回来复命，却没有等来部将，这使得对赣州城是否产生变卦而感到怀疑，他把部队分成两部分，第一部分八百八旗兵先进城，等城内安全，剩下一部分再进城也不迟。
赣州城城墙上由明军和乡勇假扮绿营兵在城墙上巡逻，留守的八旗兵铠甲也被换上，从城外看没有任何区别，当第一批八百八旗兵，昂着头从小南门进城，秦楚看见清军分成两部分，立即下令改变计划，由刘良能率领全军骑兵去游斗城外八旗兵，其余人以最快速度歼灭入城八旗兵。
八旗兵进城后，城门立即被关上，在城外杨遇明听见城内炮声大作，大叫不好，立即率军冲上去，想从其他两门支援城内八旗兵，却被刘良能率领骑兵从东西两门冲出来，两千左右明军骑兵死死挡住八旗兵，也不和八旗兵一对一厮杀，就是利用骑兵高速冲击力和游走能力，将八旗兵死死拦在城外，杨遇明不顾伤亡，带领部下一步一步往赣州城小南门杀去，想尽快救出城内八旗兵。
在城内的八旗兵，被虎蹲炮一顿轰炸，大量将士被炮弹炸开后的碎片击中，死伤狼藉，炮击结束后，又被明军弓箭和火铳洗礼，在最前和周围八旗兵几乎毙命，明军并没有冲上来肉搏，而是继续用远程武器攻击八旗兵。
八旗兵很快就从慌乱中调整过来，直接冲击明军炮台，在他们面前，李长刀和郭渊带领乡勇勇敢冲上来，面对残余八旗兵，乡勇终于一雪前耻，利用人多优势，痛打落水狗，数千人围攻八旗兵，八旗兵人少，却仍旧是以命换命，残余四百多八旗兵仍旧是杀死八百多乡勇，才被全部歼灭。
城内八旗兵被歼灭后，秦楚下令在城内军队出击，城内明军和乡勇从城内杀出来，和刘良能骑兵共同出击，将杨遇明围在赣州城外草地上，杨遇明遇事不慌，指挥八旗兵和明军游斗，八旗兵中蒙古八旗也有两百余人，也都是骑兵，和明军骑兵交手中，占据绝对优势，每一次和明军骑兵对冲，都能带走成片明军骑兵性命。
刘良能那个气啊，他本人骑术还算不错，就是手底下骑兵战斗力太差，很多人就是骑着马的步军，只有极少数骑兵有能力和蒙古八旗一战，看着越来越多骑兵被蒙古八旗干掉，他亲自带领二十名骑兵冲击蒙古骑兵，蒙古骑兵也发现刘良能这一只骑兵，集体调转马头往刘良能冲来。
刘良能高举长枪，和身后的部下高喊：“拼了，咱明骑还就不如人吗？”
秦楚在城墙上看着骑兵表现，很不满意，和从小在马背上长大游牧民族相比较，明军骑兵就是幼儿园水平，不过他不担心刘良能安全，因为勾皮和杨巴龙已经率领六百弓箭手，运动到蒙古骑兵对面，在蒙古骑兵冲锋一刹那，就开始对蒙古骑兵进行射杀。
六百只箭头从刘良能等骑兵头顶飞过，直接飞入蒙古骑兵阵营中，射杀数十个蒙古骑兵，蒙古骑兵毫不畏惧，一轮弓箭并不能阻拦他们冲锋步伐，早佐领带领下继续冲向刘良能，刘良能身边已经聚集七百多明军骑兵，他将长枪望天空一举，下令集团冲锋，在冲锋前勾皮又一次下令射击，第二轮箭雨没有对蒙古骑兵带来多大伤害，但是得蒙古骑兵速度有些放缓，这一来一去时间，刘良能率领明军骑兵却先杀入蒙古骑兵中，双方骑兵对骑兵，蒙古骑兵被明军骑兵夹在中间，失去冲击能力，只能是骑在马上和明军互砍，明军骑兵又得到乡勇支持，在骑兵和步军攻击下，两百蒙古八旗兵纷纷授首。
杨遇明还在指挥满八旗和汉八旗继续对抗明军，但是随着蒙古八旗全军覆没，明军骑兵主力再一次杀入战场，满八旗兵和汉八旗兵被轮番冲击，不断有士兵被成群明军砍成尸块，八旗兵拼尽全力，还是未能阻拦明军步步前进，明军前锋已经杀到距离他只有五十多米距离，他再也坐不住了，抛弃部下秘密突围。
杨遇明秘密突围，却逃不过明军眼睛，秦楚下定决心歼灭杨遇明这只军队，没有杀死杨遇明或者俘虏他，他可以去赣南地区召集军队来攻击赣州城，所以秦楚下达必杀令，明军中骑兵疯狂追击杨遇明，杨遇明部下已经被明军消灭殆尽，身边没有一个部下保护他的安全。
而他知道自己必须要逃出去，为了躲避明军追击，并没有向赣南赶去，而是往南安府寻找刘武元，向刘武元寻求帮助。
他一人一骑，不停地敲打马屁股，只要逃到南安府，就还有东山再起机会，赣州府只有赣州城和雩都城被明军占领，其他各地还在清军手中，向刘武元借兵，还可以反败为胜，他也不可惜战死在赣州城八旗兵，只要能够逃回去，就还能带回来大批八旗兵和精锐绿营兵打回来，在逃跑路上他发誓要复仇，不杀死这群明军他这辈子誓不为人。
胯下战马像是知道主人心思，奔跑速度也越来越快，突然战马的脚踝，被从道路上伸出来几根木棍击中，战马在高速奔跑中飞了出去，马上杨遇明也随之飞出去，等他从地上爬起来时候，已经有三把铁刀架在脖子上，他看着铁刀架在脖子上，也放松身体，任由明军将他捆起来。
他被徐仁才逮住了，徐仁才带着他来到赣州城，战场已经被打扫干净，八旗兵中满八旗和蒙古八旗全部战死，汉八旗有五十多人选择投降，他耷拉着脑袋，被徐仁才拉倒秦楚面前，看着面前年轻人，就只说一句话，士可杀不可辱，请求速死。
秦楚正在和郭渊商量怎么处置杨遇明，两人一致认为不能轻易杀掉他，郭渊有些恶趣味，向秦楚建议，让杨遇明和尼堪作伴，想必尼堪在黟县很寂寞吧。
当杨遇明被带进来时，秦楚直接和徐仁才说道：“带他下去，不要让他死了。”
杨遇明瞪着眼睛大骂秦楚：“你是何人？为什么不杀我？是要留着我用来羞辱吗？”
郭渊赶紧给秦楚贴金：“我家大人是徽州府都指挥使，秦指挥使，你听说过秦大人大名吗？”
杨遇明虽然不认识秦楚，但是怎么不知道秦楚大名，可他偏偏当做不知道，就是一副傲慢样子，郭渊继续说道：“不认识也没有关系，让你和尼堪作伴，让尼堪给你介绍介绍，你就知道了。”
杨遇明心里大惊，尼堪自从和金声恒一起进攻南直隶金声，就再也没有出现过，都以为他已经战死，没有想到被明军活捉，他表面上不作声色，内心是波涛汹涌，他想继续和秦楚说几句，却被徐仁才带下去。
随着杨遇明被俘虏，秦楚取得赣州城会战全面胜利，不仅收复赣州城，切断清军后勤，还缴获一大批粮草等物资，赣州城中粮草和武器足够六千人吃上一个月之久，还有一些火铳和火药，这些都被明军一一笑纳。
不仅如此，秦楚还得到一只数千人乡勇军队，随后秦楚以朝廷都指挥使名义，下令赣州府各地速速归降，秦楚光复赣州府消息也被无限放大，他派人去向金声汇报，在庐州府的金声得到消息后，赶紧让人去福建向隆武帝报喜。
隆武帝现在在福州日子比以前好过多了，虽然还是郑芝龙等人傀儡，但是在外朝廷大军接连取得胜利，郑芝龙对他态度也越来越好，他让印绶监起草圣旨，命令秦楚为兵部左侍郎，赏黄金五百两，当然等圣旨传达到秦楚这里，已经是一个月后的事情，毕竟很多道路被清军阻断，能够把圣旨传到就已经是很不容易事情。
赣州城被官军光复，带动赣州府其他各地义军风起，秦楚下令郭渊、李长刀、聆听阳各带一千兵马去其他各地接受政权，赣州各地清军纷纷撤出城池，只有靠近建昌府的石城和宁都还在清军控制范围，其他各地清军和选择投降清军本土势力，不是选择再一次投降，就是撤到隔壁南安府，祈求刘武元庇护。
收复各地后，秦楚在赣州府得到兵力一万八千人，这些人大都是乡勇和义军组成，成分也很复杂，对秦楚也并无效忠可言，把秦楚当成盟主一类角色，毕竟秦楚只是外来户，秦楚这是名义上首领，不过秦楚也不见外，毕竟主力部队还在江西鏖战，必须要打通主力部队南下通道，就必须赶走在石城和宁都两地清军。
此时石城和宁都两地清军也都是一脸懵逼，在石城的熊全更是一脸诧异，明军是怎么进来的，他作为建昌府守备，怎么没有接到部下汇报，建昌府不还是好好地吗？
他赶紧带着亲兵回到广昌，达到广昌城后，城墙上士兵立即打开城门，迎接他入城，他也不辨真伪，带着部下直接入城，在城门口埋伏三百明军士兵，聆听阳更是在城墙上候命，能够拿下熊全最好，拿不下就直接射杀此人。
熊全也是大马哈，在石城这些天把身体搞得发虚，率领部下入城后，也不看看清楚周围士兵啥模样，直接往城内他所住的院子走去，走着走着，才发现不太对劲，怎么周围士兵都很陌生？
他赶紧下令停止前进，猛地回头往身后城墙看去，只见城墙上士兵全部冷眼相待，心想这几天不见，城内士兵倒有几分精气神？
“熊全”
突然耳边传来一阵炸裂声音，是城内各地想起熊全二字，他大惊，周围部下也都大惊，没有继续做出下一部动作，从城内冲出来数百多明军士兵，用弓箭和火铳将他们围起来，一个部将刚刚抽出大刀，就被一箭射中于太阳穴，登时到底毙命。
是聆听阳一箭射死部将，他缓缓放下手中长弓，对着熊全高声喊道：“熊全，我乃大明狼喉营千总，建昌府已被朝廷光复，尔等还不束手就擒？”
熊全看着周围明军将士，用散发出寒光箭镞对准他们，只要他不答应，这些箭镞会立即飞入他的身体，他深吸一口气，下令投了，几十个部下也都把武器扔在地上，任由明军将他们俘虏，随后熊全也被拉下马，和部下一起被聆听阳带上，准备一起赣州城和秦楚汇合。
这边把熊全给俘虏了，已经攻占赣州城的秦楚，并没有被胜利冲昏头脑，而是亲自带领主力部队进攻石城和宁都，这两地清军有一千余人，两地城掎角之势。
抵达宁都后，秦楚先是劝降，劝降无果后，立即下令强攻，已经得到大半个赣州府支持的明军，不再惧怕石城和宁都两地清军抵抗，在五千多乡勇进攻下，宁都只抵抗半天时间，就被攻破，剩下石城一城，守将弃城而逃，带着部下逃亡抚州府，明军一天之内光复两地，打通徽州府军南下通道，秦楚立即下令马锡和谭功轩两部南下赣州府，各部门一半官员也随着军队一起行动，迅速抵达赣州府，在赣州府站稳脚跟。
秦楚攻破赣州城消息很快传遍江西各地，正在前线督战的叶臣大惊，他立即下令全军撤出进攻南昌府战斗，全军合力向西进攻瑞州府，打通去往湖广地区通道，同时命令总兵胡有升率军五千前往南安府，加强刘武元守备力量，防止明军一次性攻占赣南所有地区。
而正在南昌府祈求活命的金声恒，在得知秦楚攻占赣州府以后，在房间里高呼吾命有救，在江西其他各地明军也纷纷受到鼓舞，一扫之前颓废之气，和清军作战中也是越战斗越猛，清军被迫进行战术防守。
当抚州府清军也撤到临江府，和中军汇合后，六万清军猛攻瑞州府，瑞州府明军没能够守住清军鱼死网破，被清军突破瑞州府防线，叶臣得以带领清军主力往湖广长沙府退去，至此，清军在江西只保留南安府一块地盘，其他各州府也都被明军光复。
得知叶臣逃窜后，秦楚立即进行三步走，首先命令情报部和金声恒沟通联系，商讨以徽州府换取赣州府，第二是命令徽州府军民分批次撤到赣州府，同时命令王献和聆听阳部占据建昌府和抚州府，这两地清军势力已经被一扫而空，被徽州府军轻而易举占领，对此金声恒也没有话说。
第三步是面对赣州府本土势力，赣州府和徽州府不同，清军南下后赣州府军民虽然被清军祸害，死伤不少人，对清军仇恨程度也很深，但还存在庞大本土宗族势力，秦楚想要在赣州府立稳山头，必须要打压本土势力，在得到岳令柒等本土乡勇和周福东等中小地主支持，秦楚已经具备分化瓦解赣州本土势力资本。