前方的船是西班牙人的，西班牙接到了马尼拉总督菲利普的信件，知道吕宋竟然被大明军队攻占后，国内大怒。西班牙国王腓力四世在众多贵族的怒吼中做出决定：讨伐大明。
西班牙国力在此时已经逐渐下降，和英格兰战争的失败，给西班牙的国运罩上了一层阴影。但也因为这场失败，使得西班牙人更看重自己的面子，大明的行为已经严重地触怒了西班牙人的尊严。西班牙从本土出动了五十艘大型战舰，并集合现在在亚洲的各殖民地战舰，共计一百艘战舰，一百二十艘后勤船，组成达两万五千人的舰队，向着马尼拉进发。
这已经是西班牙所能拼凑出来的最强海上力量了，比之无敌舰队的三万人也已经相差无已。在西班牙人看来，大明这个老大帝国，陆上战力也许还凑合，但说起海战，只配给西班牙人洗脚。
西班牙舰队向东而来，等来到棉兰老岛时，遇到了颜思齐的东海舰队。东海舰队的三桅炮船比西班牙的大型战舰略小，但火力要稍强些，只是整个东海舰队一共才有二十条三桅炮船，其它的全是些海沧船，蜈蚣船，沙船之类的，火力较差，一般能有几尊小口径的火炮就已经不错了。
在这巨大的火力差距之下，颜思齐并没有立即撤退，他在发现西班牙舰队时立即派快船送信给郑芝龙和陈厚甫，然后就指挥舰队与西班牙人开始了对攻。
明军的开花弹给了骄傲的西班牙人一个难忘的教训，而在颜思齐的指挥下，在放火船，子母船，蜈蚣船等不停地骚扰下，明军依靠局部的火力优势，很是让西班牙人吃了些苦头。
但西班牙人的船大，人多终究还是在一段时间后占据了优势。颜思齐也不与他们缠斗，充分发挥了他的老本行海盗的本色，边打边跑，很快就将笨重的西班牙人抛在了身后。
在东海舰队逃，西班牙人追的过程中，郑芝龙的舰队从西班牙人后面扑了过来。他接到颜思齐的信后，立即收拢各处海岛的兵力，等他赶到颜思齐舰队前准备一起来抗西班牙人时，颜思齐道：“没用的，你的火力更差，不如你先让西班牙人过去，然后袭击他们后方的船只，只要打劫了他们的后勤船，他们支持不了多长时间的。”
郑芝龙按计行事，攻击西班牙的后勤船。他的部下大多是凶狠的海盗，对于这种抢物资的事最是擅长，等到前面的西班牙人发现后面的后勤船被抢后，急忙派船赶来时，已经只能看到几艘烧得正旺的运输船。
郑芝龙将物资转送到附近的隐密海岛后，又远远地跟在西班牙人后面，时不时地出击，快速地将落后的西班牙船吃下，连人带船一起掳走，搞得西班牙人不得不排成紧密阵形，以免后院起火。
而颜思齐的东海舰队也不时地用三桅炮船回头对西班牙船进行突袭，一时西班牙人气得乱叫，却没有办法，只能够集中起来不停地向前追击。
颜思齐又碰到了来支援的陈厚甫，两人商议后，决定将西班牙船引入马尼拉港口，利用岸上的炮台来对付西班牙船。而这时张千方遇到的正是追击颜思齐的西班牙舰队。他命令除了中华号以外的九艘船一起攻击敌船，大明号和大汉号当前充到，舰首的三十六斤炮发出怒吼，一颗炮弹正好打在西班牙的一艘战舰的前甲板上，甲板上破了一个大洞，然后猛地燃起火光，原来正好点燃了甲板上已经晒得很干的浸油的缆绳。
西班牙船和福船比较起来，便象是侏儒面对巨人。大明号在前，鼓足了帆，直接向前冲去，有躲闪不及的西班牙船发出令人牙酸的声音，然后就断成了两截。
大明号冲人敌船队中后，两舷的火炮开始发射，这些侧炮也达到了二十四斤，而且胜在数量多，射速快，很快就将多艘西班牙船打得散架或者起火。
后面的赶缯船和双篷船也比西班牙船要大，而且火力要强得多，明军舰队排成一条线冲锋，两边都是敌人，根本不用担心误伤友军，而敌人又打不到自己，这样子打仗实在是太爽了。
最后一艘中华号上的学生们躲在舷窗边看着一艘艘燃烧的西班牙船，不由得连连惊叹。宋应星道：“我等在国内，可不知道在这海外地方，竟然也有如此奇丽的战争场面，今日可算是大开了眼界。”
旁边的海军士兵心里暗笑，还奇丽，你现在看到的是我们压着别人打，两方相当的时候，那就只有残酷了，真是书生呀，幸福的书生呀。
其它学生也一起赞叹，有的竟然吟起边塞诗来，大家都觉得新鲜有趣，当然是因为现在受到伤害的是别的民族。周延儒倒是觉得这是一个难得的教育机会，于是说道：”皇帝陛下曾经说过，中华哭不如外族哭，如果我们大明人不努力，被别的民族欺压，那滋味可就不好受了。想一想以前辽东的汉民，再看看我们如今的幸福生活，大家当然应该明白如何做吧。“
宋应星道：”皇帝陛下高瞻远瞩，我们只需要听从皇帝陛下的教导，官不贪，将敢战，我们学生便应该响应皇帝陛下的号召，好好学习科学知识，造出一种机械，发现一种新物种，改良一项新技术，又何愁我大明不兴，我大汉不兴，我中华不兴。“
众人一起拍手欢呼，旁边一名海军军官道：”这位先生说得真是好。俺不大读书，不会说话。但我们的皇帝陛下，可真是大明的中兴圣君呀。俺原来是辽东的，建奴打来，杀了俺父母姐妹，俺几兄弟想要报仇，便投了毛总督，这才几年时间，便已经将建奴歼灭，俺们也报了这血海深仇。“
宋应星看这军官身材高大，面色黝黑，手掌却洁白如玉，说道：”将军原来是东江镇的好汉子，快意恩仇，实乃大丈夫所为，佩服佩服。“
那军官道：”不敢当将军之称，大明皇家海军少校耿仲明谢过先生称赞。“